為加強本澳對流感疫苗和流感大流行的應對能力，衛生局已在2004年建立自己的流感病毒學監測系統。目前該系統已加入了世界衛生組織的全球流感監測網絡，和世界衛生組織設立在澳洲的流感病毒參比實驗室建立了合作關係。衛生局的公共衛生化驗所病毒學實驗室分離和初步鑒定的流感病毒會送到該參比實驗室作進一步鑒定。

本澳流感病毒監測結果顯示，2004-2005年冬季分離到的流感病毒中，2003-2004年冬季沒有發現的H1N1新喀里多尼亞 (New Caledonia)亞型病毒占了較大部分; 這一變化可能是2004-2005冬季流感流行較嚴重的原因；而檢出的H3N2病毒則屬加州（California）亞型。

由於每年流行的流感病毒不同，世界衛生組織根據世界各地的流感病毒流行情況制定每年流感疫苗之成份。本澳常年流感高峰期在每年的一至三月份，衛生局一般在每年的下半年購買最新的流感疫苗，以便於9-12月份期間為市民接種疫苗。有需要的市民應在該段期間接種，並每年重複接種以確保預防效果。

此外，因有市民查詢流感大流行疫苗事宜，衛生局特別指出流感大流行與常年流感不同，是由新的可在人與人之間高效率傳播的流感病毒所引起的，由於無法預測引起大流行的病毒，故不可能在大流行開始之前生產及儲備有效的疫苗。

衛生局呼籲市民必須採取以下措施，以保持身體健康:

流感預防措施

— 注意個人衛生，經常洗手，特別是被口鼻分泌物污染時，以保持雙手清潔；

— 打噴嚏或咳嗽時應掩口鼻，並小心處理口鼻排出的分泌物；

— 避免前往人多擠迫、空氣流通情況欠佳的公眾地方；

— 均衡飲食、足夠的水分、適量運動、充足休息，避免過度疲勞和避免吸煙，以增強抵抗力；

— 若有發燒及呼吸道症狀，特別是兒童、老人及患有長期慢性病患者，應戴上口罩盡快找醫生診治。