市政署化驗處持續監察本澳飲用水、泳池及泳灘水質，對入口鮮活食品、冷鏈食品及食安監督樣本等進行檢測工作；同時也會就研究及化驗方面向其他公共部門和實體提供協助。實驗室配置一系列先進檢測儀器設備，保證檢測結果的可靠性和準確性。
自2011年日本福島核事故以來，市政署一直對進口食品的輻射水平採取嚴格風險管理措施，以確保其食用安全。化驗人員每日收到進口食品檢測樣本後，會首先為樣本作核素檢測前處理。
完成核素檢測前處理後，化驗人員透過各類型專業儀器，檢測進口食品的放射性核素，判定樣本是否均符合本澳食安標準。
根據《食品安全法》規定，市政署統籌食品安全的監督管理工作。化驗人員透過實驗室內不同類型的儀器設備，檢測食品樣本中的農藥及獸藥殘留量、重金屬物質含量及二氧化硫殘留量等，為食品安全提供技術保障。
市政署持續於入口及市售層面抽取各種食品樣本進行化驗，構建“雙重防線”。市售層面每年抽檢食品樣本超過3,000個，檢測項目超過10,000個，今年起更引入“神秘顧客”抽樣模式，食安人員會以一般消費者身份選購餐飲食品。
市政署化驗人員在生物安全櫃內進行微生物學樣本分離確認，食品樣本常應用酶聯免疫螢光分析儀進行微生物學初篩檢測，如檢出沙門氏菌時會採用血清學試驗進行細菌鑑定。
市政署的實驗室於2003年取得ISO/IEC 17025實驗室認可證書。與時俱進，化驗處不斷作出完善，提高及優化檢測技術水平，保持合符國際標準要求，以維護廣大居民的用水及食用安全。
